量身定制的全基因组测序技术可使罕见疾病的诊断率提高一倍

量身定制的全基因组测序技术可使罕见疾病的诊断率提高一倍然而，对这些数据的解释可能异常具有挑战性。事实上，许多患有复杂、罕见遗传病的人仍然没有得到关于其问题原因的分子答案。在这项研究中，研究人员试图为这类患者提供一个更好的机会，让他们接受基因诊断。这项研究是在UCL皇后广场神经学研究所的伦敦线粒体中心和UCL大奥蒙德街儿童健康研究所进行的，其结果将于今天（11月7日）发表在《自然通讯》杂志上。为了实现他们的目标，研究人员测试了使用由专业医生、生物信息学家和科学家组成的基因组医学团队如何能够提升NHS诊断实验室的能力，使其超越标准的半自动化数据分析。UCL团队重新评估了未诊断的病例，以确定可能有助于指导进一步、更个性化分析的线索。他们随后应用了额外的生物信息学方法，使用先进的计算机技术来识别患者DNA中可能导致疾病但在常规测试中被忽略的基因改变。该研究的参与者包括102名未被诊断的患者，他们被怀疑患有原发性线粒体疾病（一大群影响儿童和成人的不可治愈的遗传疾病，与广泛的医疗问题、严重残疾和寿命缩短有关），他们通过国家卫生系统的10万个基因组项目进行了全基因组测序。这种个性化的方法将诊断率从16.7%提高到31.4%。它还在另外3.9%的患者中发现了潜在的致病变体。主要作者RobertPitceathly博士（伦敦国家医疗服务系统罕见线粒体疾病高度专业化服务的共同负责人和UCL皇后广场神经学研究所的研究小组负责人）说。"NHS在先进的遗传技术方面进行了大量的投资。因此，英国已经确立了自己在诊断性全基因组测序方面的领先地位。也就是说，一些患有罕见遗传病的人在他们的基因组被分析后仍然没有得到分子诊断。我们相信投资于专业的基因组医学团队是至关重要的，它可以确保公平地获得专门的多学科专业知识，并最大限度地提高诊断率。在我们的研究中，患者平均等待诊断的时间超过30年--我们现在有能力解决此类案件，但需要足够的劳动力规划来支持NHS诊断基因实验室实现这一目标。"接受基因诊断是很重要的，因为它允许患者获得生育计划当中专属的试管婴儿和药物试验的机会。它还可以允许对已知的疾病并发症进行有针对性的筛选，并获得药物研究的机会。Pitceathly博士说。"在这项研究中，每一个新的基因诊断都对病人护理产生了直接影响。这包括对心脏问题、听力损失和糖尿病的额外检查，以及获得临床试验的机会"。UCL皇后广场神经学研究所所长MichaelHanna教授说。"这项工作是在开发使基因组分析为患者带来最大利益的最佳方法方面迈出的重要一步。它清楚地表明，通过将基因组分析的自动化方法与熟练的多学科团队的数据解释相结合，诊断率会翻倍。这是一个重要的发现，它将影响基因组医学诊断服务在世界范围内的发展"。共同作者詹姆斯-戴维森博士（大奥蒙德街医院代谢医学部，英国遗传性代谢疾病小组主席）说。"对于患有罕见、复杂疾病的儿童和成人来说，达成诊断的过程可能非常漫长，而基因组医学在帮助达成这一目标方面提供了一个变革性的强大工具。这项研究强调了专业临床医生和遗传科学家在解释基因组测序结果方面的合作的重要性，以最大限度地增加达成诊断的机会，然后帮助指导医疗管理和治疗方案。"患者故事RachelNorth是参与该试验的患者之一，她将获得诊断描述为"改变了生活"。此后，它让她接受了疾病并发症的筛查，如骨质疏松症，这些都得到了治疗。她说。"在过去的20年里，我去了那么多医院，找了那么久，我从来没有想过我会得到准确的诊断。思考这个问题占用了很多精力，我担心我12岁的儿子，担心我的病情是否会影响他。因此，得到罕见隐性遗传的诊断是一种解脱，消除了对未知的恐惧。有了诊断，我就可以研究我的病情，并非常主动地管理它。任何能帮助我了解和理解发生在我身体上的事情的东西，都能帮助我接受它，并给我信心，我正在尽可能地管理它。"...PC版：https://www.cnbeta.com.tw/articles/soft/1332045.htm手机版：https://m.cnbeta.com.tw/view/1332045.htm

“女孩基因突变最快48秒睡着”上热搜 像她这样的我国还有70万人

“女孩基因突变最快48秒睡着”上热搜像她这样的我国还有70万人一个基因突变，让23岁女孩获得随时都能睡着的“能力”：从关灯到睡着平均只用2.8分钟，最短一次只用48秒。到医院检查发现，她HLA-DQB1的等位基因上显示突变阳性。PC版：https://www.cnbeta.com/articles/soft/1315141.htm手机版：https://m.cnbeta.com/view/1315141.htm

迄今最大规模的研究发现与前列腺癌高发人群有关的新基因因素

迄今最大规模的研究发现与前列腺癌高发人群有关的新基因因素在英国，每四个非洲裔男性中就有一个在其一生中被诊断为前列腺癌。在美国，非裔美国人被诊断为前列腺癌的可能性是白人男性的1.7倍，死亡的可能性是白人男性的2.1倍。众所周知，遗传易感性在患前列腺癌的风险中起着很大作用。不为人知的是，为什么非洲裔男子特别容易患这种疾病。在此之前，只对这些男性进行了小规模的全基因组关联研究（GWASs），试图确定非洲裔的特定风险变异。由南加州大学凯克医学院的研究人员领导的一项新的荟萃分析，对GWAS数据进行了有史以来最大的分析，以检查这些风险因素。研究人员还开发了一个多血统多基因风险评分（PRS），包括与前列腺癌风险和疾病侵袭性相关的已知和新的风险变异。PRS可以揭示一个人的健康风险与其他具有不同基因构成的人相比的情况。它通常被计算为性状相关的等位基因的加权总和，这些等位基因是从生物父母那里继承来的、发生在染色体上某一基因位点的匹配基因。大多数性状是由两个以上的等位基因引起的，有些性状是由两个或更多的基因位点控制的。研究人员汇集了从美国、非洲和加勒比地区进行的10个GWAS收集的数据，其中包括来自8万多名男性的数据：19378个前列腺癌病例和61620个健康对照。他们发现了9个以前未知的前列腺癌遗传风险因素，其中7个在非洲裔男性中更常见，或只在非洲裔男性中发现。在8q24染色体区域发现的一个新变体，已知与前列腺癌的易感性有关，只在非洲裔男性中发现。该研究的通讯作者ChristopherHaiman说："这个特殊的变体正在影响这个人群中的侵袭性疾病风险。迄今为止，绝大多数的研究都是在欧洲血统的人群中进行的，这给我们对疾病的遗传风险的理解带来了巨大的偏差。"荟萃分析还证实了在以前的研究中看到的模式，即遗传学在决定年轻男性的癌症风险方面起着关键作用。它还强调了在未来的大规模基因研究中包括不同人群的必要性。该研究对新的遗传变体的识别现在可以被纳入基因测试，以帮助确定一个人的癌症风险，并指导他们多早和多频繁地接受筛查。对非洲裔男性进行更准确的PRS将有助于早期识别那些患前列腺癌的高风险人群。该研究的主要作者FeiChen博士说："在被诊断为侵略性疾病的男性中，前列腺癌的生存率明显较低。我们的研究结果表明，这些多基因风险评分可能有助于识别那些可能从更早和更频繁的筛查中受益的男性。"海曼和他的同事们计划继续研究非洲裔男性的前列腺癌，包括如何获得护理和其他社会决定因素对该疾病的发病率、进展和生存率的影响。该研究发表在《欧洲泌尿学》杂志上。...PC版：https://www.cnbeta.com.tw/articles/soft/1348423.htm手机版：https://m.cnbeta.com.tw/view/1348423.htm

报告：英国儿童肥胖率及青年糖尿病发病率上升

报告：英国儿童肥胖率及青年糖尿病发病率上升本世纪初起儿童健康状况的问题就令人担忧。自2006年以来，英格兰10岁和11岁儿童的肥胖率上升了30%。法新社报道，慈善机构食品基金会星期三（6月19日）发布的这份名为《被忽视的一代：扭转英格兰儿童健康状况的下降》的报告将因体重问题而苦苦挣扎的儿童数量的增加描述为“令人深感担忧”。自2013年以来五岁儿童的身高稳步下降，25岁​​以下人群的二型糖尿病发病率上升，在过去五年中上升了22%。报告的作者说，潜在原因包括“令人震惊的贫困和匮乏程度”以及“食品行业大力推广廉价垃圾食品”。他们补充说，英国最近的生活成本危机“加剧”了许多家庭在餐桌上提供健康、营养食品方面所面临的困难。前政府食品顾问丁布尔比在报告中说，这种下降“令人震惊且深感悲哀”。他敦促无论哪个政党在7月4日赢得英国大选，都要“采取果断行动，让健康和可持续的食品变得负担得起，并阻止垃圾食品的升级”。研究表明，五分之一的儿童在10岁到11岁离开小学时就已肥胖，这使他们以后患上二型糖尿病的风险更大。报告称，政治领导人必须“扭转目前的轨迹”。“如果不这样做，一代人将终生承受与饮食有关的疾病及其带来的后果的负担。”这些后果将包括精神和身体健康问题，以及“不堪重负的医疗保健系统无法有效地治疗患者，经济不活跃削弱了国内生产总值。2024年6月19日11:01PM

研究发现免疫细胞在抵御感染的一生中获得基因组“疤痕”

研究发现免疫细胞在抵御感染的一生中获得基因组“疤痕”根据一项新研究，科学家们对被称为淋巴细胞的免疫细胞进行了更详细的基因测序，以研究这些细胞的突变如何影响衰老过程。免疫细胞的基因测序的分辨率比以往任何时候都要高，使人们深入了解它们如何以及何时积累突变，例如那些与某些癌症的发展有关的突变。在这项研究中，来自惠康桑格研究所、约克大学约克生物医学研究所的研究人员和合作者创造了一个新的协议，使他们能够从一个细胞中生长和测序B细胞和T细胞的菌落，这种技术也可用于其他研究领域。该研究于2022年8月10日发表在《自然》杂志上，发现在健康B细胞中看到的突变与在癌症B细胞中看到的突变基本相似，这表明癌症的发展产生于同样的突变过程。更多地了解导致这些突变在一些细胞中发展成癌症而不是其他细胞的因素，可能有助于阐明这种疾病的起源。这些被称为淋巴细胞的免疫细胞的突变也可能影响衰老和免疫系统的其他疾病，并且发现更多关于这些突变在人的一生中何时以及如何发生的信息，增加了我们关于在衰老过程中发生的知识。被称为淋巴细胞的免疫细胞是适应性免疫系统的一部分，包括记忆B细胞和记忆T细胞，这两种细胞都经历了一定程度的基因突变，以便能够识别和抵御病原体。在这项新的研究中，科学家们发现，虽然这种正常的基因突变主要针对的是抗体的基因，但在基因组的其他地方也会发生令人惊讶的附带损害。正是这种脱靶突变会导致淋巴细胞发生癌变，并发展成为一种被称为淋巴瘤的癌症。除此之外，他们还发现，当淋巴细胞在体内扩散以调查感染情况时，它们会接触到额外的DNA破坏剂，这可能会进一步增加突变的数量。该团队对七个捐赠者的700多个正常免疫细胞进行了基因组测序，这些捐赠者的年龄从0到81岁不等。他们发现，B细胞和T细胞的突变数量和模式在不同的细胞之间有广泛的差异。其中一些变异是由突变随年龄增长而积累造成的，而其他变异是由抗体的正常基因增强对基因组的非目标损伤造成的。另外，一些变异是由阳光造成的DNA损伤引起的，因为淋巴细胞通过皮肤调查感染情况。研究小组发现，健康免疫细胞中的一些突变与已经在淋巴瘤中发现的突变相同，这表明淋巴瘤产生于与正常免疫细胞中相同的潜在突变过程。细胞与细胞之间的差异比人与人之间的差异大得多，这表明一个人一生中身体不同部位的变化，如某些感染和炎症，比基因的遗传性突变更有可能导致与癌症和疾病有关的突变。该研究对健康淋巴细胞的突变情况和导致这些突变的过程有了更深入的了解，这增加了目前对衰老的理解。需要进一步研究这些突变和过程在不同组织之间有多大差异，以调查这些是否为未来的治疗提供任何途径。“适应性免疫系统随着我们的年龄增长发生了很多变化，但以前不可能像我们在这里取得的那样对其进行详细研究。我们的研究是朝着了解淋巴细胞中的突变如何随时间积累以及这些突变对衰老过程的影响迈出的又一步。PC版：https://www.cnbeta.com/articles/soft/1304843.htm手机版：https://m.cnbeta.com/view/1304843.htm

新技术追踪人类基因组 暴露其有害突变的进化弱点

新技术追踪人类基因组暴露其有害突变的进化弱点他们发现，基因组的一些区域更容易受到突变的影响，表明那里的任何突变都可能产生灾难性或致命的后果。他们的结果可能有助于临床医生寻找严重遗传疾病的原因。Siepel的程序的名称是ExtRaINSIGHT。它通过寻找有害的突变来寻找它们的缺失。人类基因组的每个区域都应该偶然包含突变，然而某些区域却没有突变。Siepel将这些地方称为"超选"。发生的改变可能是致命的，或大大降低繁殖的可能性。"如果我们在一个由十万个人组成的小组中，从未看到某个特定基因的突变，这表明任何发生的突变都是非常有害的，任何携带该突变的人都会从人群中死亡。"科学家们用ExtRaINSIGHT分析了超过7万个人类基因组。他们发现，基因组的三个部分特别容易受到跨代突变的影响。剪接点是其中最敏感的部分。剪接位点帮助产生正确的指令来制造蛋白质。这个区域的突变可能会对基因被传递的可能性产生重大影响，它们与一些疾病有关，包括脊髓性肌肉萎缩症，这是导致新生儿和幼儿死亡的主要遗传原因。Siepel说："如果你看到一个剪接点的突变，你最好认真对待它。仅仅是这个突变就会使你的体质下降1或2%。这听起来不多，但如果你有多个这样的突变，很快你的基因传承的机会就可能接近于零。"被称为miRNA的分子和中枢神经系统的基因也很敏感。"如果你在miRNA中发现一个突变，很有可能它是一种遗传疾病的罪魁祸首，"Siepel说。"而且由于神经系统是如此复杂和相互关联，它似乎对突变特别敏感。"许多遗传性疾病和病症的起源仍然是一个谜。Siepel希望ExtRaINSIGHT这样的技术将有助于揭示它们的起源并指导诊断和未来的治疗。他还希望他的工作将有助于进一步说明突变如何继续塑造人类基因组的进化。...PC版：https://www.cnbeta.com.tw/articles/soft/1335231.htm手机版：https://m.cnbeta.com.tw/view/1335231.htm