研究人员发现引发COVID-19的冠状病毒的关键"弱点"

研究人员发现引发COVID-19的冠状病毒的关键"弱点"英属哥伦比亚大学的研究人员发现了SARS-CoV-2病毒的所有主要变体的一个关键漏洞，包括新发现的BA.1和BA.2Omicron亚变体。中和抗体可以针对这一弱点，有可能为对各种变体普遍有效的治疗打开大门。冷冻电子显微镜显示了VHAb6抗体片段（红色）如何附着在SARS-CoV-2尖峰蛋白（灰色）的脆弱部位，以阻止病毒与人类ACE2细胞受体（蓝色）结合。这项研究发表在《自然-通讯》杂志上，它使用低温电子显微镜（cryo-EM）来确定病毒尖峰蛋白上的脆弱区域或表位的原子结构。该研究还报告了一个VHAb6抗体片段，它能与该位置结合并中和每一个主要变体。UBC大学医学院教授、该研究的资深作者SriramSubramaniam博士说："这是一种高度适应性的病毒，已经进化到可以逃避大多数现有的抗体治疗，以及疫苗和自然感染赋予的大部分免疫力。这项研究揭示了一个弱点，这个弱点在不同的变体中基本没有变化，可以被一个抗体片段中和。它为设计有可能帮助许多脆弱人群的泛变种治疗方法创造了条件。"识别COVID-19的万能钥匙我们的身体自然地制造抗体来对抗感染，但它们也可能在实验室中被制造出来，并作为一种治疗方法给病人使用。尽管已经为COVID-19创造了一些抗体治疗方法，但面对像Omicron这样高度变异的变体，它们的疗效已经下降。"抗体以一种非常具体的方式附着在病毒上，就像一把钥匙进入一把锁。但当病毒发生变异时，钥匙就不再适用了，"Subramaniam博士说。"我们一直在寻找万能钥匙--即使在广泛的变异后仍能继续中和病毒的抗体。这篇新论文将抗体片段VHAb6确定为"万能钥匙"，已经发现它对Alpha、Beta、Gamma、Delta、Kappa、Epsilon和Omicron变种有效。通过与尖峰蛋白上的表位结合并阻止SARS-CoV-2感染人体细胞，该片段可中和病毒。这一发现是苏布拉马尼亚姆博士的团队与匹兹堡大学MitkoDimitrov和WeiLi博士领导的同事之间长期而富有成效的合作的最新成果。匹兹堡的团队一直在筛选大型抗体库并测试它们对COVID-19的有效性，而UBC的团队一直在使用低温电镜研究尖峰蛋白的分子结构和特征。专注于COVID-19的薄弱点UBC团队因其在使用低温电镜以原子分辨率观察蛋白质-蛋白质和蛋白质-抗体相互作用的专业知识而闻名于世。在今年早些时候发表在《科学》上的另一篇论文中，他们首次报告了Omicron尖峰蛋白和人类细胞受体ACE2之间的接触区结构，为Omicron增强的病毒适应性提供了分子解释。通过绘制每个尖峰蛋白的分子结构图，该团队一直在寻找可能为新疗法提供信息的脆弱区域。苏布拉马尼亚姆博士说："我们在这篇论文中描述的表位大多远离突变的热点，这就是为什么它的能力在不同的变体中得以保留。现在我们已经详细描述了这个部位的结构，它开启了一个全新的治疗可能性领域。"Subramaniam博士说，这个关键的弱点现在可以被制药商利用，而且由于该部位相对无突变，所产生的治疗方法可以对现有的，甚至是未来的变种有效。PC版：https://www.cnbeta.com/articles/soft/1311789.htm手机版：https://m.cnbeta.com/view/1311789.htm

科学家创造强大的新抗体 能中和所有已知的COVID-19变体

科学家创造强大的新抗体能中和所有已知的COVID-19变体随着SARS-CoV-2的变化和变异，在大流行早期有效的治疗性抗体已经失去了效力，而更多最近的变种，特别是奥密克戎（Omicron），已经学会了如何规避我们的系统对疫苗接种产生的抗体。由于波士顿儿童医院创造的一种新的、广泛的中和抗体，我们可能能够更好地防范可能的变异。在测试中，它中和了所有已知的SARS-CoV-2变体，包括所有奥密克戎变异株。波士顿儿童医院细胞和分子医学项目的FrederickAlt博士说：“我们希望这种人源化抗体将被证明在病人身上中和SARS-CoV-2，就像它迄今为止在临床前评估中被证明的那样有效。”在发表在《科学免疫学》上的一项研究中，Alt和SaiLuo博士利用其实验室以前用来寻找针对HIV（另一种经常变异的病毒）的广义中和抗体的人源化小鼠模型的改进版。由于小鼠实际上具有内置的人类免疫系统，该模型与我们的免疫系统用来创造越来越有效的抗体的试错过程非常相似。研究人员最初将两个人类基因片段引入小鼠体内，使它们的B细胞在短时间内创造出广泛的人源化抗体。他们随后将小鼠暴露在病毒的SARS-CoV-2刺突蛋白的原始毒株中，这是我们的抗体和当前疫苗所针对的主要蛋白。改良后的小鼠发展出9个品系或“家族”的人源化抗体，这些抗体在反应中与刺突蛋白结合。Alt和Luo与BartonHaynes博士领导的杜克大学团队一起，评估了这些抗体的功效。九个品系中的三个品系的抗体在中和原始毒株方面是有效的。特别是SP1-77抗体和它的其他成员，表现出极其广泛的活性，可以中和Alpha、Beta、Gamma、Delta以及所有以前和现在的Omicron病毒株。是什么导致SP1-77抗体具有如此广泛的中和作用？由波士顿儿童医院的陈兵博士和张军博士领导的合作小组以及杜克大学的海恩斯小组进行的结构研究表明，SP1-77的工作方式与目前的抗体（无论是治疗性抗体还是我们为应对目前的疫苗而制造的抗体）不同。许多现有的抗体通过在某些区域附着在刺突蛋白的受体结合域（RBD）上发挥作用，阻止SARS-CoV-2与细胞的ACE2受体结合，这是感染的最初步骤。SP1-77抗体也与RBD结合，但以一种完全不同的方式，并不能阻止病毒与ACE2受体结合。波士顿儿童医院的合作者AlexKreutzberger博士和TomasKirchhausen博士使用一个新型活细胞成像平台，表明SP1-77阻止病毒将其外膜与靶细胞的膜融合。这阻挠了向感染敞开大门的最后一个必要步骤。这些特征可能为新的SARS-CoV-2疫苗的设计提供参考。Kirchhausen说：“SP1-77在一个迄今尚未在任何SARS-CoV-2变体中发生突变的部位结合刺突蛋白，通过一种新的机制广泛地中和目前的变体。”...PC版：https://www.cnbeta.com/articles/soft/1312889.htm手机版：https://m.cnbeta.com/view/1312889.htm

为什么Omicron与众不同？新研究有助于解释SARS-CoV-2变体迅速传播的原因

为什么Omicron与众不同？新研究有助于解释SARS-CoV-2变体迅速传播的原因一个多国研究小组发现，与早期变种相比，SARS-CoV-2的Omicron变种能更有效地与细胞结合，并能更好地躲避抗体。该研究还指出，事先接触病毒或接种疫苗仍能在一定程度上预防较新变种的严重疾病。这项研究的主要作者是华盛顿大学医学院生物化学教授大卫-维斯勒（DavidVeesler）实验室的研究生阿明-阿德提亚（AminAddetia）和研究科学家朴英俊（Young-JunPark），以及瑞士贝林佐纳HumabsBioMed公司的主任卢卡-皮科利（LucaPicolli）和圣路易斯华盛顿大学医学院的詹姆斯-布雷特-凯斯（JamesBrettCase）。维斯勒也是霍华德-休斯医学研究所的研究员，他是这项研究的负责人。Veesler说："在过去一年中占据主导地位的Omicron变种，如BQ.11和XBB.1.5，对宿主细胞上的受体血管紧张素转换酶2有很高的亲和力，它们能够与细胞膜融合，入侵效率比以前的SARS-CoV-2Omicron变种要高得多。"自2019年SARS-CoV-2在中国武汉爆发以来，该病毒一直在不断进化。原始毒株的新变种不断出现。在某些情况下，这些变种的适应性较低，从而限制了它们的传播。但在另一些情况下，更有效的变种却造成了一波又一波的感染和死亡。在第一个名为BA.1的Omicron龙变种之后，又出现了一系列变种，每个变种都发生了突变，从而提高了感染和传播能力。这些变种包括BA.2、BA.4、BA.5、BQ.1.1、XBB及其衍生物XBB.1和XBB.1.5。计算机生成的与SARS-CoV-2病毒尖峰蛋白结合的中和抗体（浅蓝色）图像。图片来源：LexiWalls和DavidVeeslerSARS-CoV-2病毒还能使曾感染过早期变种病毒的人再次感染，并突破为预防早期变种病毒而设计的疫苗的免疫保护。维斯勒和他的同事发现，这些再感染和突破性感染之所以可能，是因为新的变种能够躲避因接触早期变种而诱发的抗体。这种抗体被称为中和抗体，它能在入侵病毒立足之前迅速清除，从而防止感染。不过，研究人员也发现，先前的感染或疫苗接种确实有助于产生能识别较新变体上某些蛋白质的抗体。这些抗体能成功激活免疫细胞，通过杀死和消灭受感染的细胞来根除感染。维斯勒说，这种免疫反应也许可以解释为什么以前接触过早期变异体或接种过针对它们的疫苗似乎可以降低再次感染较新变异体后患重病、住院和死亡的风险。虽然针对早期变种产生的大多数抗体的中和活性大大降低，但一种名为S309的抗体的有效性却得以保留。这种抗体针对的是病毒尖峰蛋白上的一个区域，该区域在不同变体之间往往保持相对不变，这可能是因为它的作用对病毒的功能至关重要。维斯勒说："S309仍能识别所有这些变体，并中和它们（尽管效率较低），促进细胞反应，并在动物实验中防止疾病发生。"科学家们解释了为什么以前感染过或接种过早期变体的疫苗不能像早期变体那样有效地防止新变体感染的一个原因：免疫系统的反应往往是产生由以前的变体诱导的抗体，并与较新的变体产生交叉反应，而不是产生专门针对新变体上改变的蛋白质而定制的新抗体。维斯勒怀疑这是由于一种叫做"免疫印记"的现象造成的，在这种现象中，免疫系统对类似病毒新感染的免疫反应在很大程度上受到免疫系统先前反应的影响。这种免疫印记导致免疫系统专注于它所知道的东西，而不是学习新的技巧来应对新变体中发现的突变。维斯勒说，这种现象就是为什么针对新变种的疫苗不应该含有旧变种的成分的原因之一，因为旧变种可能会有利于免疫印记，导致免疫反应不那么有效。...PC版：https://www.cnbeta.com.tw/articles/soft/1381047.htm手机版：https://m.cnbeta.com.tw/view/1381047.htm

日本发现所有Covid 变体都是实验室制造

日本发现所有Covid变体都是实验室制造日本大阪医科大学和京都大学的田中惇贵和宫沢孝幸在他们的研究中追踪SARS-CoV2，Omicron变体的历史演变。在过去的三年中，严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2（SARS-CoV-2）多次出现大流行，产生了从阿尔法到奥米克龙的各种变异株。在本研究中，我们的目标是阐明导致SARS-CoV-2Omicron变异体形成的进化过程，重点研究SARS-CoV-2分离株中尖峰蛋白中存在多个氨基酸突变的Omicron变异体。为了确定导致SARS-CoV-2Omicron变体形成的突变顺序，我们比较了129个与OmicronBA.1相关的分离株、141个与BA.1.1相关的分离株和122个与BA.2相关的分离株的序列，试图分解SARS-CoV-2Omicron变体的进化过程，包括导致SARS-CoV-2Omicron变体形成的突变顺序和同源重组的发生。因此，我们得出结论，部分Omicron分离物BA.1、BA.1.1和BA.2的形成并不是自然界中常见的基因组进化的产物，如突变积累和同源重组。此外，对35个奥米克龙变体BA.1和BA.2重组分离物的研究证实，奥米克龙变体在2020年就已经存在。我们在此所做的分析表明，Omicron变体是通过一种全新的机制形成的，无法用以往的生物学原理来解释，而了解SARS-CoV-2变体的形成方式，则促使人们重新考虑SARS-CoV-2的流行。https://zenodo.org/record/8216373

研究显示COVID-19感染包括多种SARS-CoV-2病毒变体

研究显示COVID-19感染包括多种SARS-CoV-2病毒变体凯斯西储大学（CWRU）的研究人员对360名COVID-19患者的病毒感染进行了基因排序。他们发现SARS-CoV-2病毒有广泛的遗传变异，表明所有的个体感染都包括病毒的多种变体。研究人员指出，有关该病毒的报告通常强调一个单一的优势毒株。这导致了对病毒遗传变异的报道不足，并可能在公共卫生计划和反应中产生严重后果。PC版：https://www.cnbeta.com/articles/soft/1315833.htm手机版：https://m.cnbeta.com/view/1315833.htm

实验室测试显示一种新抗体能中和所有已知的新冠病毒变种

实验室测试显示一种新抗体能中和所有已知的新冠病毒变种随着COVID-19大流行的持续，SARS-CoV-2的较新变种一直在进化，以逃避我们身体对疫苗接种或先前感染所产生的抗体。突破性的病例已经产生，而曾经有效的抗体治疗也随着时间的推移变得不那么有效。科学家们一直在寻找一种具有广泛中和作用的抗体，能够对抗可能出现的任何病毒变体。哈佛医学院和波士顿儿童医院的研究人员开发的一种抗体现在似乎符合这一要求。在实验室测试中，它中和了目前所有已知的SARS-CoV-2变体，包括所有的Omicron变种。研究结果于8月11日发表在《科学免疫学》上。在阿尔特和波士顿儿童医院儿科的HMS讲师SaiLuo的带领下，该团队首先修改了阿尔特实验室创建的小鼠模型，以寻找针对HIV的广义中和抗体，这是另一种经常变异的病毒。这些小鼠基本上都有内置的人类免疫系统。修改后的模型模仿并完善了我们自己的免疫系统在遇到入侵者时用来创造越来越有效抗体的试验和错误过程。研究人员首先将两个人类基因片段插入小鼠体内。这促使小鼠的免疫细胞迅速产生类似于我们身体可能产生的各种抗体。研究小组随后让小鼠接触SARS-CoV-2尖峰蛋白，这是我们的抗体和目前的疫苗所针对的主要蛋白质。作为回应，小鼠产生了九个不同的"家族"抗体，与尖峰蛋白结合。研究人员随后测试了这些抗体的有效性。九个"家族"抗体中的三个"家族"抗体强烈地中和了原始的新冠病毒。但是一个抗体家族，特别是一个被称为SP1-77的抗体，显示出更广泛的活性，可以中和α、β、γ、δ以及所有以前和现在的omicron病毒株。是什么让SP1-77在中和病毒方面如此出色？由波士顿儿童医院罗莎琳-富兰克林博士的儿科教授BingChen、波士顿儿童医院儿科HMS讲师JunZhang和杜克大学的BartonHaynes领导的合作团队的结构生物学研究表明，这种抗体以一种独特的方式发挥作用。为了感染我们，SARS-CoV-2必须首先附着于我们细胞上的ACE2受体。我们为应对疫苗而制造的许多抗体，以及用于治疗COVID-19的抗体，都能阻止这种结合。它们是通过在特定位置附着在尖峰的受体结合域上来实现的。SP1-77抗体也与受体结合域结合，但以一种不同的方式，它并不阻止病毒与ACE2受体结合。一旦病毒与ACE2结合，它必须完成最后一步：将其外膜与我们的细胞膜融合。这就为感染打开了大门。研究人员使用一个新的活细胞成像平台，表明SP1-77能阻止这一步骤。SP1-77在一个迄今尚未在任何变种中发生突变的部位与穗状蛋白结合，而且它通过一种新的机制中和这些变种，这些特性可能有助于其广泛和有效的活性。如果这些发现最终能在人类身上得到复制，那么这些抗体可能会带来更好的COVID-19疫苗和治疗。研究人员已经为这些抗体和用于生产这些抗体的小鼠模型申请了专利。他们希望看到他们的工作得到商业化发展。PC版：https://www.cnbeta.com/articles/soft/1306057.htm手机版：https://m.cnbeta.com/view/1306057.htm